胡庆余堂建筑群内，点缀着数量可观、品位上乘的匾额、楹联。这些楹联匾额，不仅是胡庆余堂建筑艺术的有机组成，为建筑群落增加几分典雅色彩，而且承载着国药文化特有的深刻的内涵，包含着中国传统书法、文学、哲学的精萃，也反映了店铺主人的品味和追求，凸现了胡庆余堂的经营宗旨和理念。
它们是胡庆余堂“根脉”和“魂灵”的载体，也是人们解读和传承国药文化的亮点。
庆云在霄甘露被野；余粮访禹本草师农。此联为嵌名联。上联意为吉祥之云在天上飘悠，雨霖甘露普洒原野；下联中余粮为药用矿石，产于池泽者为禹余粮，产于山谷者为太一余粮。《雷公炮制论》：凡使禹余粮，勿用石中黄并卵石黄，此二名石真似禹余粮也。意为使用余粮这种药石，要认准禹余粮，使用草本植物要师法神农尝百草。
朱草炼成金丹妙药；元霜捣就玉杵奇功。意为各种本草经过反复提炼结晶成可以治病的灵丹妙药，元白的粉霜是经过千百次捣磨才发挥药到病治的独特功效。寓意胡庆余堂的方剂成药都是细研精制的，没有偷工减料。
饮和食德；俾寿而康。系流水对，刻在青龙招牌上。说的是饮食适可，有规律，可以使人健康而且长寿。又在隐喻胡雪岩立意，要吃掉杭城另两家资格老、规格大的药号“许广和”与“叶种德堂”。
益寿引年长生集庆；兼收并蓄待用有余。韩愈《进学解》中有“玉札丹砂，赤箭青芝，牛溲马勃，败鼓之皮，俱收并蓄，待用无遗者，医师之良也。”之句。意为地榆、朱砂、天麻、龙芝、车前草、马勃菌、坏了的鼓皮都收藏起来，比喻物虽微贱而无所不用，这是医道高明。此为埋尾联，寓意胡庆余堂是助人益寿而积福，贮藏药物而行医。
娲皇补天炼五色石；稚川入山採九光芝。传说中女娲炼石补天拯救世界；晋代炼丹方士葛洪（字稚川），进入深山，采来了七明九光芝（灵芝中的仙品）。此联意味胡庆余堂在养生保健上卓有成效，修制灵丹妙药，以济苍生。
野山高丽东西洋参；暹罗官燕毛角鹿茸。此属中药名联。上联四种参的名称和产地，高丽即朝鲜，东洋参产于日本，西洋参以美国为佳；下联为泰国正宗燕窝、暹罗是泰国旧称，官方经营的称“官燕”。此联在“药局”匾额下，表明药局富有各种名贵药材，且来源广阔，地道正宗。
海为龙世界；云是鹤家乡。意为大海为蛟龙遨游的世界，高空为仙鹤翱翔的家乡。寓意有志者可凭借大舞台创一番伟业。此联为清代书法家、金石大家邓石如的一幅匾对，配以“扬州八怪”金农竹画。邓石如精于“真草隶篆”四书，功力极深。此联为草书，神采飞扬，意境开阔，气韵生动。
七闽奇珍古称天宝；三山异草原赖地灵。七闽：泛指福建沿海一带，三山：福建旧称。意为产自福建沿海一带的奇稀珍物从来都是老天恩赐的宝贝，得于深山老林中的异珍草木向来依靠高原沃土的滋润。
披林听鸟；酌酒和风。此联为清末民国初著名学者、思想家康有为所撰写，意为进山林寻幽静听鸟语，把盏饮酒沐临清风，这是平静而和谐的意境，心旷神怡。康有为书法学养深厚，笔法朴拙高古，耐人寻味。